Лазер применяется в два раза чаще для хирургических операций, дополняя или заменяя скальпель. Важной особенностью лазерной хирургии, является, то, что болевые ощущения после операции практически отсутствуют. Благодаря этому при стоматологических операциях лазером требуется меньшая доза анестетиков. Раны заживают быстрее и кровоточивость снижается до минимума. Применяется лазерная хирургия при лечении парадонтальных карманов, иссечении уздечек губ и языка, операциях на деснах, при лечении афтозного стоматита, удаления кист и др.